[gulea2580@mail.ru]

Здравствуйте!Я гражданка России,жила длительное время в Казахстане,получила там вид на жительство,была прописана по месту жительства.В моем российском паспорте были поставлены казахские печати "зарегестрирован по месту жительства"и"снят с регистрации".В настоящее время я выехала на ПМЖ в Московскую область,есть листок убытия,собралась прописываться у родственников,а мне в паспортном столе сказали что не могут сразу меня прописать потому что им не понятно почему в Казахстане мне ставили штампы о прописке в российский паспорт,и что такой паспорт теперь надо менять.Так что мне теперь делать?

[merquzio]

Всё верно - паспорт, в который внесены сведения, отметки или записи, не предусмотренные Положением о паспорте гражданина РФ, является недействительным.
В вашем случае это

казахские печати "зарегестрирован по месту жительства"

так что вам необходимо менять паспорт.