[Serf_85]

В данном случае, исчисление делает заказчик, а сумма страховых взносов уплачива6ется из общей суммы договора, которая причиталась исполнителю (так пояснили бухгалтера). Т.к. это не трудовой договор, а гражданско-правовой

[Erling]

Пишите ПРОСТО ЦЕНУ. 13% от неё удержите, ОТ НЕЁ ЖЕ исчислите взносы, которые потом уплатите.

Глупо писать "цена 100 рублей, из них столько-то НДФЛ, столько-то взносов, а столько-то на водку и селёдку". Потому что взносы вы будете исчислять и платить ОТ ПОЛНОЙ СУММЫ, которую получит подрядчик.
Сумма взносов не может "входить в цену", так как она будет исчисляться исходя из этой цены.
По этой же причине, например, госпошлина не входит в цену иска. Она исчисляется исходя из этой суммы. А как бы она могла быть исчислена, если сама же в эту сумму входила бы?